De associatie van leeftijd, geslacht en RT-PCR results met the aantal lymphocyte en neutralofielen in SARS-CoV-2 infection: a double-door analysis of 1450 Iraanse patiënten met COVID-19

Die Eindämmung von Pandemie-Infektionen hängt hauptsächlich von der sofortigen Identifizierung der Träger ab, die durch strenge Überwachung und wahrheitsgemäße diagnostische Exams erreicht werden kann. Obwohl die molekulare Identifizierung des schweren akuten respiratorischen Syndroms Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) die Goldstandardmethode ist, sind seine geringe Empfindlichkeit und lange Durchlaufzeit eines der Hauptprobleme.

In dieser retrospektiven Single-Middle-Studie haben wir die Ergebnisse der Lymphozyten- und Neutrophilenzahlen von 1450 iranischen Patienten mit Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19) überprüft, die im Baqiyatallah Hospital, Teheran, Iran, rekrutiert wurden. Von 1450 Patienten waren 439 Fälle (30,3% ) negativ für die Polymerasekettenreaktion (PCR);; Hervorheben, dass unfavorable molekulare Exams nicht so zuverlässig sind wie constructive Ergebnisse.

Während die Lymphozytenzahl in Fällen mit weniger als 50 Jahren 1,8 × 103 / µL (1,2-2,5) betrug, betrug sie in der älteren Gruppe 1,47 × 103 / µL (0,84-2,16) (p <0,001). Auch Männer hatten im Vergleich zu Frauen niedrigere Lymphozyten (1,53 × 103 / & mgr; l gegenüber 1,76 × 103 / & mgr; l; p = 0,002). Von besonderem Interesse conflict, dass die Lymphozytenzahl in den PCR-negativen Fällen 1,77 × 10 3 / & mgr; l (0,98–2,45) betrug, was signifikant höher conflict als die Anzahl in ihren positiven Gegenstücken (1,53 × 10 3 / & mgr; l; p = 0,004).

Im Gegensatz zu Lymphozyten hatten Geschlecht und PCR keinen signifikanten Einfluss auf die Anzahl der Neutrophilen. Das Odds Ratio für Neutrophilie bei Patienten über 50 Jahren, entweder mit negativer oder positiver PCR, betrug 2,46 und 2,23, was darauf hindeutet, dass das Alter der wichtigste assoziierte Faktor ist.

Die Anzahl der Lymphozyten zusammen mit einer erhöhten Neutrophilenzahl kann wahrscheinlich als einfacher, schneller und wirtschaftlicher Biomarker dienen und scheint ein geeigneter Punkt zu sein, der bei der Identifizierung von Patienten mit COVID-19 berücksichtigt werden sollte, insbesondere von Patienten über 50 Jahren.

Analysieren Sie die Echtzeit-RT-PCR-Primer in Sonden für SARS-CoV-2

Schnelltests für aktive SARS-CoV-2-Infektionen beruhen auf der reversen Transkriptionspolymerasekettenreaktion (RT-PCR). Die RT-PCR verwendet die reverse Transkription von RNA in komplementäre DNA (cDNA) und die Amplifikation spezifischer DNA- Ziele (Primer und Sonde) unter Verwendung der Polymerasekettenreaktion (PCR). Die Technologie ermöglicht eine schnelle und spezifische Identifizierung des Virus basierend auf der Sequenzhomologie der Nukleinsäuresequenz und ist viel schneller als Gewebekultur- oder Tierzellmodelle.

Die Technik kann jedoch mit der Zeit an Empfindlichkeit verlieren, wenn sich das Virus entwickelt und die Zielsequenzen von den selektiven Primersequenzen abweichen. Verschiedene Primersequenzen wurden in verschiedenen geografischen Regionen übernommen.

Da wir uns auf diese vorhandenen RT-PCR-Primer verlassen , um die Ausbreitung des Coronavirus zu verfolgen und zu steuern, ist es wichtig zu verstehen, wie SARS-CoV-2-Mutationen im Laufe der Zeit und geografisch von den heute verwendeten vorhandenen Primern abweichen.

In dieser Studie analysieren wir die Leistung der heute verwendeten SARS-CoV-2-Primer, indem wir die Anzahl der Fehlpaarungen zwischen Primersequenz und Genomzielen über die Zeit und räumlich messen. Wir stellen fest, dass es eine wachsende Anzahl von Fehlpaarungen gibt, eine Zunahme um 2% professional Monat sowie eine hohe Spezifität des Virus basierend auf der geografischen Lage

2x SYBR Green qPCR Master Mix (High ROX)
B21402	Bimake	5 ml	EUR 268.8
Description: 2x SYBR Green qPCR master mix (High ROX) utilizes a special performance-enhanced Taq DNA polymerase protected via a hot-start activation technique, and optimized qPCR buffer system to perform SYBR

2x SYBR Green qPCR Master Mix (High ROX)
B21403	Bimake	25 ml	EUR 1027.2
Description: 2x SYBR Green qPCR master mix (High ROX) utilizes a special performance-enhanced Taq DNA polymerase protected via a hot-start activation technique, and optimized qPCR buffer system to perform SYBR

SYBR Green qPCR Master Mix (No ROX)
HY-K0523	MedChemExpress	5 mL (500 rxns )	EUR 308.4

SYBR Green qPCR Master Mix (Low ROX)
HY-K0522	MedChemExpress	5 mL (500 rxns )	EUR 308.4

SYBR Green qPCR Master Mix (High ROX)
HY-K0521	MedChemExpress	1 mL (100 rxns)	EUR 135.6

2x SYBR Green qPCR Master Mix
B21202	Bimake	5 mL	EUR 268.8
Description: Our 2x SYBR Green qPCR master mix performs toe to toe in all qPCR assays with the most well known brands on the market but surpases them significantly in cost-efficiency.

2x SYBR Green qPCR Master Mix
B21203	Bimake	25 mL	EUR 1027.2
Description: Our 2x SYBR Green qPCR master mix performs toe to toe in all qPCR assays with the most well known brands on the market but surpases them significantly in cost-efficiency.

SYBR Green qPCR Master Mix
HY-K0501	MedChemExpress	5 mL (500 rxns)	EUR 315.6

HotStart™ 2X SYBR Green qPCR Master Mix
K1070-25	ApexBio	25ml	EUR 420

HotStart™ 2X SYBR Green qPCR Master Mix
K1070-5	ApexBio	5ml	EUR 120

HotStart™ 2X SYBR Green qPCR Master Mix
K1070-50	ApexBio	50ml	EUR 840

HotStart™ Universal 2X SYBR Green qPCR Master Mix
K1170-25	ApexBio	25ml	EUR 420
Description: qPCR Kit, Universal SYBR Green I Master Mix (Rox)

HotStart™ Universal 2X SYBR Green qPCR Master Mix
K1170-5	ApexBio	5ml	EUR 120
Description: qPCR Kit, Universal SYBR Green I Master Mix (Rox)

HotStart™ Universal 2X SYBR Green qPCR Master Mix
K1170-50	ApexBio	50ml	EUR 840
Description: qPCR Kit, Universal SYBR Green I Master Mix (Rox)

AceQ qPCR SYBR® Green Master Mix
Q111-02	Vazyme	500 rxn (20 μl/rxn)	EUR 265.2

AceQ qPCR SYBR® Green Master Mix
Q111-03	Vazyme	2500 rxn (20 μl/rxn)	EUR 775.2

ChamQ SYBR qPCR Master Mix (Without ROX)
Q321-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 96.44

ChamQ SYBR qPCR Master Mix (Without ROX)
Q321-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 434.8

TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *No ROX*
17270-1mL	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99
Description: TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *No ROX*
17271-5mL	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308
Description: TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix (Without ROX)
Q421-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 112.5

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix (Without ROX)
Q421-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 507.2

TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *Low ROX*
17272-1mL	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99
Description: TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *Low ROX*
17273-5mL	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308
Description: TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *High ROX*
17274-1mL	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99
Description: TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *High ROX*
17275-5mL	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308
Description: TAQuestâ„¢ qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *No ROX*
17276-1mL	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99
Description: TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *No ROX*
17277-5mL	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308
Description: TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *Low ROX*
17278-1mL	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99
Description: TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *Low ROX*
17279-5mL	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308
Description: TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *High ROX*
17280-1mL	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99
Description: TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green *High ROX*
17281-5mL	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308
Description: TAQuestâ„¢ FAST qPCR Master Mix with Helixyteâ„¢ Green is a ready-to-use 2X solution optimized for qPCR and 2-step RT-qPCR.

TAQuest™ qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *No ROX*
17270	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99

TAQuest™ qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *No ROX*
17271	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308

TAQuest™ qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *Low ROX*
17272	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99

TAQuest™ qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *Low ROX*
17273	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308

TAQuest™ qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *High ROX*
17274	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99

TAQuest™ qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *High ROX*
17275	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308

TAQuest™ FAST qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *No ROX*
17276	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99

TAQuest™ FAST qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *No ROX*
17277	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308

TAQuest™ FAST qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *Low ROX*
17278	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99

TAQuest™ FAST qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *Low ROX*
17279	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308

TAQuest™ FAST qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *High ROX*
17280	AAT Bioquest	1 mL	EUR 99

TAQuest™ FAST qPCR Master Mix with Helixyte™ Green *High ROX*
17281	AAT Bioquest	5 mL	EUR 308

ChamQ SYBR qPCR Master Mix (Low ROX Premixed)
Q331-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 96.44

ChamQ SYBR qPCR Master Mix (Low ROX Premixed)
Q331-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 434.8

ChamQ SYBR qPCR Master Mix (High ROX Premixed)
Q341-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 96.44

ChamQ SYBR qPCR Master Mix (High ROX Premixed)
Q341-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 434.8

Genious 2X SYBR GREEN FAST qPCR MIX (No ROX)
RK21205	Abclonal	1 ml	Ask for price

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix (Low ROX Premixed)
Q431-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 112.5

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix (Low ROX Premixed)
Q431-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 507.2

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix (High ROX Premixed)
Q441-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 112.5

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix (High ROX Premixed)
Q441-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 507.2

ChamQ SYBR qPCR Master Mix
Q311-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 96.44

ChamQ SYBR qPCR Master Mix
Q311-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 434.8

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix
Q411-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 112.5

ChamQ SYBR Color qPCR Master Mix
Q411-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 507.2

AceQ Universal SYBR qPCR Master Mix
Q511-02	Vazyme	500 rxn (20 μl/rxn)	EUR 265.2

AceQ Universal SYBR qPCR Master Mix
Q511-03	Vazyme	2500 rxn (20 μl/rxn)	EUR 775.2

ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix
Q711-02	Vazyme	500 rxn (20 μl/rxn)	EUR 265.2

ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix
Q711-03	Vazyme	2500 rxn (20 μl/rxn)	EUR 775.2

Genious 2X SYBR Green Fast qPCR Mix
RK21204	Abclonal	1 mL	Ask for price

2X Universal SYBR Green Fast qPCR Mix
RK21203	Abclonal	1 mL	Ask for price

iGreen 2X qPCR Master Mix with Low-ROX, 500Rxns-20ul
A4183-4x125ML500Rxns	Biomatik Corporation	4x1.25ML (500Rxns)	EUR 200.2
Description: Biotechnology

Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix
Q712-02	Vazyme	500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 128.8

Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix
Q712-03	Vazyme	2,500 rxns (20 μl/rxn)	EUR 580

BrightCycle Universal SYBR Green qPCR Mix with UDG
RK21219	Abclonal	5mL	EUR 475

miRNA Universal SYBR® qPCR Master Mix
MQ101-01	Vazyme	125 rxn(20 μl/rxn)	EUR 165.6

miRNA Universal SYBR® qPCR Master Mix
MQ101-02	Vazyme	500 rxn(20 μl/rxn)	EUR 290.4

lyophilised real-time PCR Master Mix with SYBR® Green fluorescent DNA stain
M-PCR-173L	MiTeGen	960 reactions x 20 µl	EUR 897
Description: lyophilised real-time PCR Master Mix with SYBR® Green fluorescent DNA stain

lyophilised real-time PCR Master Mix with SYBR® Green fluorescent DNA stain
M-PCR-173S	MiTeGen	192 reactions x 20 µl	EUR 224
Description: lyophilised real-time PCR Master Mix with SYBR® Green fluorescent DNA stain

Fast Plus EvaGreen qPCR Master Mix with low Rox (5000 rxn)
31014-2	Biotium	50x1mL	EUR 4291.2
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 50x1mL

Fast Plus EvaGreen qPCR Master Mix with high Rox (5000 rxn)
31015-2	Biotium	50x1mL	EUR 4291.2
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 50x1mL

Fast Plus EvaGreen qPCR Master Mix with low Rox (500 rxn)
31014-1	Biotium	5x1mL	EUR 524.4
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 5x1mL

Fast Plus EvaGreen qPCR Master Mix with high Rox (500 rxn)
31015-1	Biotium	5x1mL	EUR 524.4
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 5x1mL

Forget-Me-Notâ„¢ EvaGreen qPCR Master Mix with ROX (500 reactions)
31042-1	Biotium	5x1mL	EUR 326.4
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 5x1mL

Forget-Me-Notâ„¢ EvaGreen qPCR Master Mix with ROX (200 reactions)
31042-20mL	Biotium	2x10mL	EUR 592.8
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 2x10mL

Forget-Me-Notâ„¢ EvaGreen qPCR Master Mix with ROX (100 reactions)
31042-T	Biotium	1mL	EUR 136.8
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 1mL

Entrans 2X qPCR Probe Master Mix with UDG
RK21222	Abclonal	50RXN	EUR 71

Fast Plus EvaGreen qPCR Master Mix with low Rox (100 rxn): (1mL)
31014-T	Biotium	1mL	EUR 160.8
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 1mL

Fast Plus EvaGreen qPCR Master Mix with High Rox (100 rxn): (1mL)
31015-T	Biotium	1mL	EUR 160.8
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 1mL

Fast Plus EvaGreen Master Mix for qPCR with Rox (200 rxn)
31014	Biotium	2x1mL	EUR 273.6
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 2x1mL

amfiSure Ultra Fidelity PCR Master Mix(2X)
P0346-001	GenDepot	1ml	EUR 336

amfiSure Ultra Fidelity PCR Master Mix(2X)
P0346-002	GenDepot	2x1ml	EUR 578.4

amfiSure Ultra Fidelity PCR Master Mix(2X)
P0346-005	GenDepot	5x1ml	EUR 993.6

amfiSure Ultra Fidelity PCR Master Mix(2X)
P0346-010	GenDepot	10x1ml	EUR 1632

Fast Plus EvaGreen Master Mix for qPCR with High Rox (200 rxn)
31015	Biotium	2x1mL	EUR 273.6
Description: Minimum order quantity: 1 unit of 2x1mL

HotStart PCR Master mix (2X, Green Dye)
BS9291	Bio Basic	5X1mL, 5ml	EUR 251.4

HotStart PCR Master mix (2X, Green Dye)
BS9292	Bio Basic	1ml	EUR 115.68

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5600-001	GenDepot	1ml	EUR 175.2

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5600-002	GenDepot	2x1ml	EUR 248.4

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5600-005	GenDepot	5x1ml	EUR 322.8

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5600-010	GenDepot	10x1ml	EUR 537.6

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5600-050	GenDepot	50x1ml	EUR 2085.6

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5700-001	GenDepot	1ml	EUR 208.8

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5700-002	GenDepot	2x1ml	EUR 319.2

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5700-005	GenDepot	5x1ml	EUR 562.8

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5700-010	GenDepot	10x1ml	EUR 886.8

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), No Rox
Q5700-050	GenDepot	50x1ml	EUR 3462

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5603-001	GenDepot	1ml	EUR 175.2

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5603-002	GenDepot	2x1ml	EUR 248.4

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5603-005	GenDepot	5x1ml	EUR 319.2

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5603-010	GenDepot	10x1ml	EUR 530.4

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5603-050	GenDepot	50x1ml	EUR 2004

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5703-001	GenDepot	1ml	EUR 208.8

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5703-002	GenDepot	2x1ml	EUR 319.2

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5703-003	GenDepot	5x1ml	EUR 562.8

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5703-004	GenDepot	10x1ml	EUR 886.8

amfiSure qProbe Q-PCR Master Mix(2X), Low Rox
Q5703-005	GenDepot	50x1ml	EUR 3462

amfiSure qGreen Q-PCR Master Mix(2X), High Rox
Q5602-001	GenDepot	1ml	EUR 175.2

SARS-CoV-2 E-Genvariante verandert analytische gevoeligheidskenmerken van virale Detektion erfüllt behulp van een kommerziellen RT-PCR-Check

Diagnosetests zum Nachweis von SARS-CoV-2 sind für das Patientenmanagement, die Infektionsprävention und die Reaktion der öffentlichen Gesundheit auf COVID-19 von wesentlicher Bedeutung . Die Wirksamkeit und Zuverlässigkeit dieser Exams ist sowohl für die Verfolgung als auch für die Kontrolle der Ausbreitung des Virus von größter Bedeutung. Echtzeit-RT-PCR-Assays beruhen auf einer festen genetischen Sequenz für Primer und Sondenbindung. Mutationen können möglicherweise die Genauigkeit dieser Assays verändern und zu unvorhersehbaren analytischen Leistungsmerkmalen und falsch negativen Ergebnissen führen.

Hier identifizieren wir eine G-zu-U-Transversion (Nucleotid 26372)im SARS-CoV-2 E-Gen in drei Proben mit verringerter Virusnachweiseffizienz unter Verwendung eines weit verbreiteten kommerziellen Assays. Eine weitere Analyse des öffentlichen GISAID-Repositorys führte zur Identifizierung von 18 zusätzlichen Genomen mit dieser Mutation, die fünf unabhängige Mutationsereignisse widerspiegeln. Diese Arbeit unterstützt die Verwendung von Twin-Goal-Assays, um die Anzahl falsch negativer PCR-Ergebnisse zu reduzieren.

Ontwikkeling en toepassing van een nieuwe Multiplex-PCR-Check für die Differenzierung van vier hämosporidische Parasieten bij de kip Gallus gallus domesticus

Hämosporidische Infektionen bei Haushühnern (Gallus gallus domesticus) sind nicht nur weit verbreitet, sondern verursachen auch wirtschaftliche Verluste. Die Diagnose wird normalerweise durch mikroskopische Untersuchung gestellt; Das Verfahren weist jedoch mehrere Nachteile auf, wie beispielsweise das Erfordernis eines erfahrenen Mikroskopikers, das unzuverlässig ist, wenn die Parasitämie gering ist, und nicht in der Lage ist, zwischen Koinfektionen von mehreren Parasitenarten genau zu unterscheiden. Daher könnte das derzeitige Ausmaß der hämosporidischen Infektionen unterschätzt und vernachlässigt werden.

Wir haben einen neuartigen Multiplex-PCR-Assay entwickelt, mit dem vier hämosporidische Parasiten gleichzeitig nachgewiesen und unterschieden werden können: Leucocytozoon caulleryi, Leucocytozoon sabrazesi, Plasmodium juxtanucleare und Plasmodium gallinaceum. Die Primer in der vorliegenden Studie amplifizierten spezifisch die entsprechenden Ziele, ohne dass eine speziesübergreifende Amplifikation nachgewiesen wurde.

Die Multiplex-PCR zeigte im Vergleich zur mikroskopischen Untersuchung eine signifikant höhere Nachweisrate (p = 0,0001) . Die Ergebnisse zeigen, dass die Nachweisrate der Multiplex-PCR für L. sabrazesi, P. juxtanucleare und P. gallinaceum alle höher ist als die der mikroskopischen Untersuchung mit p = 0,002, 0,0001 bzw. 0,004. Koinfektionen wurden auch durch Multiplex-PCR wirksamer nachgewiesen.

Wir haben die aktuelle Methode auf Feldproben aus den Provinzen Nan, Prachinburi und Chachoengsao angewendet. Die aktuelle Studie ergab, dass die positiven Raten von hämosporidischen Parasiten bei Hühnern an den drei Untersuchungsorten zwischen 39,5% und 93,8% lagen.

Der vorliegende Assay bietet eine zeitsparende Possibility für die molekulare Diagnose, anstatt Singleplex-PCRs zum individuellen Nachweis der Parasiten zu verwenden. Innerhalb einer einzigen Reaktion wäre dieser Assay ein nützliches Instrument zum Nachweis von hämosporidischen Vogelparasiten, entweder einzeln oder unter Koinfektionsbedingungen, und für groß angelegte epidemiologische Studien.

Argonaute geïntegreerd PCR-System traf één buis maakt overgevoelige Detektiv van Zeldzame Mutaties Mogelijk

Technologische Fortschritte beim Nachweis seltener DNA-Mutationen haben die Diagnose und Überwachung von Tumoren revolutioniert, sind jedoch immer noch durch das Fehlen überempfindlicher und hochbedeckter Verfahren zur Identifizierung von Mutationen mit geringer Häufigkeit begrenzt. Hier beschreiben wir ein Einröhrchen-Multiplex-PCR-basiertes System, A-Star, das ein hyperthermophiles Argonaute aus Pyrococcus furiosus (PfAgo) zum hocheffizienten Nachweis seltener Mutationen enthält, die aufgrund seiner Kompatibilität mit DNA-Polymerase vorteilhaft sind.

Diese neuartige Technik verwendet eine spezifische Führungsdesignstrategie, um eine selektive PfAgo-Spaltung mit einer Auflösung von einem Nukleotid bei 94 ° C zu ermöglichen, wodurch Wildtyp-DNA im Denaturierungsschritt größtenteils eliminiert und seltene mutierte DNA während des PCR-Prozesses effizient amplifiziert wird.

Das integrierte Einrohrsystem erreichte eine große Effizienz bei der Anreicherung seltener Mutationen im Vergleich zu einem geteilten System, das die Spaltung und Amplifikation trennt. Somit ermöglicht A-Star den einfachen Nachweis und die Quantifizierung von 0,01% seltenen Mutationen mit einer ≥5500-fachen Effizienzsteigerung.

Die Machbarkeit von A-Star wurde auch für den Nachweis onkogener Mutationen in festen Tumorgeweben und Blutproben gezeigt. Bemerkenswerterweise erreichte A-Star den gleichzeitigen Nachweis mehrerer Onkogene durch eine einfache Einzelrohrreaktion durch orthogonale, führungsgerichtete spezifische Spaltung. Diese Studie zeigt ein überempfindliches und schnelles Nukleinsäuredetektionssystem mit vielversprechendem Potenzial für Forschung und therapeutische Anwendungen.

8260 ISTD Mix (15mL bottle)
ECS-Z-041	Scientific Laboratory Supplies	15ML	EUR 295.2

Acid Spiking Mix (2000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-004	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 76.8

Semivolatile ISTD Mix (4000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-001	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 348

Semivolatile TCLP Mix (2000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-018	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 270

BRAND(TM) GLASS BOTTLE-TOP TILT PIPETTE
BR43055-1EA	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 86.4

BRAND(TM) GLASS BOTTLE-TOP TILT PIPETTE
BR43058-1EA	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 88.8

BRAND(TM) GLASS BOTTLE-TOP TILT PIPETTE
BR43066-1EA	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 96

BRAND(TM) GLASS BOTTLE-TOP TILT PIPETTE
BR43070-1EA	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 102

BRAND(TM) GLASS BOTTLE-TOP TILT PIPETTE
BR43078-1EA	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 136.8

Bottle Dropping 30ml Glass
BOT56200	Scientific Laboratory Supplies	PK6	EUR 38.4

Base/Neutral Spiking Mix (1000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-005	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 76.8

Semivolatile ISTD Mix (6) (2000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-201	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 175.2

Ethidium Bromide Dropper Bottle
40540004-1	Bio-WORLD	5 mL	EUR 23.23

Ethidium Bromide Dropper Bottle
40540004-2	Bio-WORLD	10 mL	EUR 35.69

EPA Method 625 Base/Neutral Mix 1 (2000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-030	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 478.8

Base/Neutral Surrogate Mix (3) (1000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-002	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 61.2

Base/Neutral Surrogate Mix (4) (1000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-022	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 76.8

Base/Neutral Surrogate Mix (3) (1000ppm) - 11.5mL Bottle
ECS-Z-002	Scientific Laboratory Supplies	11.5ML	EUR 114

Semivolatile Surrogate Mix (6) (1000/2000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-027	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 103.2

Acid Extractables Surrogate Mix (3) (2000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-003	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 61.2

Acid Extractables Surrogate Mix (4) (2000ppm) - 5.5mL Bottle
ECS-N-023	Scientific Laboratory Supplies	5.5ML	EUR 115.2

Acid Extractables Surrogate Mix (3) (2000ppm) - 11.5mL Bottle
ECS-Z-003	Scientific Laboratory Supplies	11.5ML	EUR 114

Bottle Dropping 50ml Glass TK Pattern
BOT5652	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 6

Nalgene Bottle Dropper 4ml LDPE Clear
BOT5800	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 54

Nalgene Bottle Dropper 8ml LDPE Clear
BOT5802	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 54

Nalgene Bottle Dropper 4ml LDPE White
BOT5806	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 52.8

Nalgene Bottle Dropper 8ml LDPE White
BOT5808	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 52.8

Nalgene Bottle Dropper 4ml LDPE Clear
BOT5812	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 55.2

Nalgene Bottle Dropper 8ml LDPE Clear
BOT5814	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 57.6

Ethidium bromide dropper bottle 10 mL
DD4905006	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 52.8

Nalgene Bottle Dropper 15ml LDPE Clear
BOT5804	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 56.4

Nalgene Bottle Dropper 15ml LDPE White
BOT5810	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 56.4

Nalgene Bottle Dropper 15ml LDPE Clear
BOT5816	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 60

Nalgene Bottle Dropper 15ml LDPE White
BOT5822	Scientific Laboratory Supplies	PK25	EUR 60

Bottle Bijou Hw 7ml No Cap
128139S	Scientific Laboratory Supplies	PK255	EUR 165.6

Bottle Duran Amber 1L No Cap
BOT7630	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 68.4

Bottle Duran Amber 2L No Cap
BOT76320	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 1059.6

Bottle Alpha amber 125ml no cap
BOT2043	Scientific Laboratory Supplies	PK104	EUR 111.6

Base/Neutral Surrogate Mix 4 component-10.5mL Bottle
ECS-Z-022	Scientific Laboratory Supplies	10.5ML	EUR 138

Acid Extractables Surrogate Mix 4 component-10.5mL Bottle
ECS-Z-023	Scientific Laboratory Supplies	10.5ML	EUR 213.6

EtBr Dropper Bottle, 10ml Ethidium Bromide, 0.625mg/ml
20-276	Genesee Scientific	1 Bottle/Unit	EUR 284

Bottle 60ml Amber Bottle
2004-0002	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 28.8

Egg Drop Syndrome PCR kit
PCR-V026-48D	Bioingentech	50T	EUR 543.6

Egg Drop Syndrome PCR kit
PCR-V026-96D	Bioingentech	100T	EUR 686.4

Duran Bottle 1000ml Square Amber
BOT5267	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 122.4

Bottle 1L HDPE Square
BOT3610	Scientific Laboratory Supplies	PK5	EUR 44.4

Azlon Polyethylene Dispensing Bottle with Spouted Dropper 250ml
BOT5706	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 3.6

Nalgene Bottle 500ml PP Square
BOT0138	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 79.2

Nalgene Bottle 125ml PE Square
BOT0174	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 36

Nalgene Bottle 250ml PE Square
BOT0176	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 54

Nalgene Bottle 500ml PE Square
BOT0178	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 64.8

Duran Bottle 100ml Square Clear
BOT5250	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 54

Duran Bottle 100ml Square Amber
BOT5251	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 54

Duran Bottle 250ml Square Clear
BOT5252	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 96

Duran Bottle 250ml Square Amber
BOT5253	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 96

Duran Bottle 500ml Square Clear
BOT5254	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 106.8

Duran Bottle 500ml Square Amber
BOT5255	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 106.8

Duran Bottle 100ml Square Clear
BOT5260	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 36

Duran Bottle 100ml Square Amber
BOT5261	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 36

Duran Bottle 250ml Square Clear
BOT5262	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 64.8

Duran Bottle 250ml Square Amber
BOT5263	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 64.8

Duran Bottle 500ml Square Clear
BOT5264	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 82.8

Duran Bottle 500ml Square Amber
BOT5265	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 76.8

Bottle Nalge Square 250Ml
2114-0008	Scientific Laboratory Supplies	PK72	EUR 247.2

Bottle 50ml Square Clear
BOT5268	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 28.8

Kartell Bottle 250ml HDPE Square
BOT3606	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 61.2

Kartell Bottle 500ml HDPE Square
BOT3608	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 44.4

Pyrex Reagent Bottle 500ml Square
1520/08D	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 133.2

Bottle
2099-0002	Scientific Laboratory Supplies	PK72	EUR 154.8

Bottle
342089-0032	Scientific Laboratory Supplies	PK24	EUR 140.4

Bottle 150ml hdpe Square Red cap
LC150A-03	Scientific Laboratory Supplies	PK300	EUR 326.4

Egg Drop Syndrome RT PCR kit
RTq-V026-100D	Bioingentech	100T	EUR 860.4

Egg Drop Syndrome RT PCR kit
RTq-V026-150D	Bioingentech	150T	EUR 969.6

Egg Drop Syndrome RT PCR kit
RTq-V026-50D	Bioingentech	50T	EUR 717.6

Nalgene Bottle 250ml PP Square WM
BOT0314	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 72

Nalgene Bottle 500ml PP Square WM
BOT0316	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 102

Bottle hdpe square 500ml wn
BGE336P	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 73.2

Square Wm Bottle Pp Nalgene
2122-0010	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 42

Nalgene Bottle 1L PP Square
BOT0140	Scientific Laboratory Supplies	PK6	EUR 51.6

Nalgene Bottle 1L PE Square
BOT0180	Scientific Laboratory Supplies	PK6	EUR 48

Nalgene Bottle 125ml PC Square Media
BOT3634	Scientific Laboratory Supplies	PK6	EUR 43.2

Nalgene Bottle 250ml PC Square Media
BOT3636	Scientific Laboratory Supplies	PK6	EUR 52.8

Nalgene Bottle 500ml PC Square Media
BOT3638	Scientific Laboratory Supplies	PK4	EUR 57.6

Duran Laboratory Bottle with GL45 neck no Cap 500ml
2180144	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 10.8

Duran Bottle 1L Square Clear
BOT5256	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 160.8

Duran Bottle 1L Square Amber
BOT5257	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 160.8

Duran Bottle 1L Square Clear
BOT5266	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 122.4

Nalgene Bottle 30ml PE Square
BOT0170	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 25.2

Nalgene Bottle 60ml PE Square
BOT0172	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 28.8

Nalgene Bottle 125ml PETP Square Media
BOT5334	Scientific Laboratory Supplies	PK48	EUR 307.2

Nalgene Bottle 250ml PETG Square Media
BOT5336	Scientific Laboratory Supplies	PK48	EUR 372

Nalgene Bottle 500ml PETG Square Media
BOT5338	Scientific Laboratory Supplies	PK24	EUR 272.4

Nalgene Bottle 1L PP Square WM
BOT0318	Scientific Laboratory Supplies	PK6	EUR 75.6

Flystuff (50-102) Drosophila Glass Stock Bottle
FLY1086	Scientific Laboratory Supplies	PK60	EUR 586.21

The egg drop syndrome (76) PCR kit
PCR-V044-48D	Bioingentech	50T	EUR 543.6

The egg drop syndrome (76) PCR kit
PCR-V044-96D	Bioingentech	100T	EUR 686.4

NVHO-1, 4 oz. bottle
NVHO-1	MiTeGen	4 oz	EUR 42
Description: NVHO-1, 4 oz. bottle

Nalgene Bottle 60ml PP Square WM
BOT0310	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 32.4

Duran Cap for Square Bottle 32mm
BOT5270	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 18

Duran Cap for Square Bottle 45mm
BOT5272	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 20.4

Duran Cap for Square Bottle 32mm
BOT5280	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 13.2

Duran Cap for Square Bottle 45mm
BOT5282	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 18

Duran Cap for Square Bottle 54mm
BOT5284	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 21.6

Duran Cap for Square Bottle 60mm
BOT5286	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 19.2

Bottle 2l square hdpe double cap
LC2002NDFRG	Scientific Laboratory Supplies	PK50	EUR 153.6

Amber Bottle
2009-0032	Scientific Laboratory Supplies	PK24	EUR 414

Sartolab bottle 1000mL
FIL1280	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 133.2

WASH BOTTLE 1 L, LDPE
1300P-1L	CORNING	12/pk	EUR 122.4
Description: Reusable Plastics; Resusable Bottles

Nalgene Bottle 1L PC Square Media
BOT3640	Scientific Laboratory Supplies	PK4	EUR 82.8

Nalgene Bottle 2L PC Square Media
BOT3642	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 43.2

Bottle 250ml Amber
BOT53060A	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 224.4

Wash Bottle LDPE 250ml Mixed pack
BOT9139	Scientific Laboratory Supplies	PK5	EUR 25.2

Egg Drop Syndrome One-Step PCR kit
Oneq-V026-100D	Bioingentech	100T	EUR 1039.2

Egg Drop Syndrome One-Step PCR kit
Oneq-V026-150D	Bioingentech	150T	EUR 1177.2

Egg Drop Syndrome One-Step PCR kit
Oneq-V026-50D	Bioingentech	50T	EUR 861.6

Nalgene Bottle 30ml PC Square Media
BOT3630	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 57.6

Nalgene Bottle 60ml PC Square Media
BOT3632	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 78

Nalgene Bottle 1L PETG Square Media
BOT5340	Scientific Laboratory Supplies	PK24	EUR 367.2

Nalgene Bottle 2L PETG Square Media
BOT5342	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 306

Bottle PP 1000ml WN
1629PK17	Scientific Laboratory Supplies	PK17	EUR 182.4

Sartolab bottle 250mL
FIL1266	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 82.8

Sartolab bottle 150mL
FIL1268	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 66

Sartolab bottle 500mL
FIL1278	Scientific Laboratory Supplies	PK12	EUR 99.6

Diagnostic Bottle - HDPE Round Bottle with PP Closure
312002-9025	Scientific Laboratory Supplies	PK2000	EUR 1897.2

bottle top filter 250mL Polysulfone fits 45mm bottle
FIL8244	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 247.2

bottle top filter 500mL Polysulfone fits 33mm bottle
FIL8246	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 322.8

bottle top filter 500mL Polysulfone fits 45mm bottle
FIL8248	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 322.8

Stuart Bottle 260x35mm
OVE3356	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 160.8

Stuart Bottle 230x70mm
OVE3358	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 244.8

Stuart Bottle 150x35mm
OVE3360	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 142.8

Duran Square Media Bottle 100ml with GL32 Cap
BOT52200	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 108

Duran Square Media Bottle 250ml with GL45 Cap
BOT52220	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 118.8

Duran Square Media Bottle 500ml with GL45 Cap
BOT52240	Scientific Laboratory Supplies	PK10	EUR 144

Quickfit sintered bottle head, 215mm ste m, porosity 1, for 500ml bottle
Z308536-1EA	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 78

Nalgene Bottle 30ml PETP Square Media
BOT5330	Scientific Laboratory Supplies	PK96	EUR 291.6

Nalgene Bottle 60ml PETG Square Media
BOT5332	Scientific Laboratory Supplies	PK96	EUR 378

Gl45 Amber Bottle 5000ml
2180673	Scientific Laboratory Supplies	EACH	EUR 314.4

WASH BOTTLE - 4L
ACCBW0002	IBI Scientific	W/TUBING	EUR 212.99

The egg drop syndrome (76) RT PCR kit
RTq-V044-100D	Bioingentech	100T	EUR 860.4

The egg drop syndrome (76) RT PCR kit
RTq-V044-150D	Bioingentech	150T	EUR 969.6