NATtrol Grippe-Überprüfungspanel (7 x 0,5 ml)

Atemwegsviren tragen wesentlich zur Morbidität und Mortalität in allen Altersgruppen bei . Eine schnelle Identifizierung ist sowohl für therapeutische Zwecke als auch für Zwecke der Infektionskontrolle wichtig. Herkömmliche virale Schnelldiagnosen wie Immunoassays liefern schnelle Ergebnisse und sind einfach durchzuführen; haben jedoch eine suboptimale Empfindlichkeit  . 

Nucleic Acid Amplification Assays (NAAT), die relativ schnell sind und eine stark erhöhte Empfindlichkeit aufweisen, werden zur Methode der WahlIn jüngerer Zeit haben weniger komplexe molekulare Plattformen von der Probe zum Ergebnis wie Xpert Flu Assay (Cepheid), RP (BioFire Diagnostics), RV+ (Nanosphere), eSensor Respiratory Viral Panel (GenMark Diagnostic) und Liat Influenza A/B (Iquum) eingesetzt auf dem Markt eingeführt, die das Potenzial haben, Ergebnisse in 1–4 h mit Direktzugriffsfunktionen bereitzustellen  . Der Hauptzweck dieser Studie bestand darin, die Leistung von zwei neuen automatisierten Echtzeit-PCR-Systemen mit einem bewährten zuverlässigen Vergleichssystem zu vergleichen .

 Ziele

Wir verglichen die Leistung von zwei IVD-zugelassenen RT-PCR-Schnelltests, RV+ und RP, mit den Ergebnissen, die mit Pro erzielt wurden. Beide schnellen Systeme sind hochgradig automatisiert und verfügen über Direktzugriffsfunktionen.

Studiendesign

Klinische Proben

Klinische Proben wurden von 89 Patienten (Altersspanne 45 Tage bis 86 Jahre, Median 7 Jahre, 60 % pädiatrische Fälle) erhalten, bei denen Atemwegsproben (90 % Nasopharynx, 8 % untere Atemwege) oder Stuhlproben (Adenovirus, 2 %) eingereicht wurden den Nachweis von Atemwegsviren und wurden zuvor von Pro als positiv bestimmt. Proben, die zwischen Januar 2008 und Februar 2012 gesammelt und bei –80 °C gelagert wurden, wurden basierend auf den Ergebnissen der ursprünglichen Tests ausgewählt. Die Proben wurden auf unterschiedliche Viren gepaart und als Zwei-Proben-Pools getestet. Abweichende Proben wurden einzeln erneut getestet, während auf Adenovirus abweichende Proben wie zuvor beschrieben durch Viruskultur überprüft wurden  . Proben wurden als richtig positiv definiert, wenn sie bei zwei oder mehr Assays positiv waren.

 Viren

Das NATtrol™ RVP Verification Panel (ZeptoMetrix, Buffalo, NY) wurde für die Analyse der Nachweisgrenze durch Reihenverdünnung (1:10) in normalem Humanplasma für den Endpunktnachweis verwendet. Virale Nukleinsäurekonzentrationsbestimmungen basierten auf quantifizierter viraler Kontroll-RNA (Hologic Gen-Probe Inc., San Diego, CA) unter Verwendung von Pro.

RV+

Die Verigene Der RV+ Test (Nanosphere, Northbrook, IL) kombiniert herkömmliche PCR mit einem Nachweissystem für Goldnanopartikelsonden. Zunächst wurden Testkartuschen, Extraktionsschalen und Amplifikationsschalen in den Processor SP geladen, nachdem die Amplifikationsschalen 10–30 Minuten lang aufgetaut worden waren. Probe im Virustransport (0,2 ml) wurde auf die Extraktionsschale gegeben. Die automatisierte Probenlysierung und Zielamplifikation von etwa 10 % des Lysats wurde auf dem Verigene Processor SP als Multiplex-Assay zum Nachweis von FluA, 09H1, sH3, sH1, FluB, RSV-A und RSV-B durchgeführt. Innerhalb von 5 Minuten nach Abschluss der Amplifikation wurde die RV+-Testkartusche aus dem Prozessor entfernt, geöffnet, um den Hybridisierungsobjektträger freizugeben, der dann in das Verigene-Lesegerät eingeführt wurde. Die Ergebnisse wurden für jedes Ziel als „erkannt“ oder „nicht erkannt“ gemeldet, oder eine Meldung „No Call“ (NC) wurde im Falle eines Assay-Versagens, wie z. B. eines Versagens einer internen Kontrolle, gemeldet. NC-Proben wurden erneut getestet, um ein gültiges Ergebnis zu erhalten.

 RP

Das FilmArray Respiratory Panel v1.6 (BioFire Diagnostics Inc., Salt Lake City, UT), das zum Zeitpunkt der klinischen Bewertung ein umfassendes Panel zum Nachweis von 15 respiratorischen viralen Targets (AdV, Coronaviren [CoV] HKU1 und NL63, FluA, 09H1, sH3, sH1, FluB, hMPV, humanes Rhinovirus/Enterovirus (HRV), PIV1–4 und RSV) durch Echtzeit-PCR. Das geschlossene System integriert Extraktion, Amplifikation und Detektion in einem einfachen, freihändigen Test. Kurz gesagt, 0,3 ml Probe im viralen Transport wurden zu 0,5 ml Probenpuffer gegeben. In den FilmArray-Beutel wurden 0,5 ml Hydratationslösung und 0,3 ml der verdünnten Probe injiziert. Der Beutel wurde in das FilmArray eingeführt und innerhalb von 70 Minuten wurden die Ergebnisse für jedes Ziel als erkannt, nicht erkannt oder ungültig gemeldet. Ungültige Proben wurden erneut getestet, um ein gültiges Ergebnis zu erhalten. Zusätzlich,

 Profi

Die Prodesse-Assays für Atemwegsviren (Hologic|Gen-Probe, San Diego, CA) sind eine Reihe von Multiplex- oder Uniplex-Echtzeit-PCR-Assays, einschließlich ProFlu+ (erkennt FluA, FluB und RSV), ProFAST+ (Differenzierung von 09H1, sH3 und sH1), ProAdeno+, ProHMPV+ und ProParaflu+ (unterscheidet PIV1–3). Kurz gesagt, virale RNA wurde aus 0,2 ml Probe im viralen Transport zusammen mit einer universellen internen Kontrolle unter Verwendung von NucliSens Magnetic Extraction Reagents und dem easyMAG-Extraktor (bioMerieux, Durham, NC) extrahiert und auf ein Volumen von 50 μl eluiert. RNA-Extrakt, 5 μl, wurde auf SmartCyclern (Cepheid, Carlsbad, CA) mit dem für klinische Zwecke erforderlichen geeigneten Assay amplifiziert.

NATtrol Flu Verification Panel (7 X 0.5 mL)

NATFVP-NNS Zeptometrix 7 X 0.5 mL 394.24 EUR

NATtrol Influenza Verification Panel (7 x 1.0 mL)

NATFVP-JAN Zeptometrix 7 x 1.0 mL 474.32 EUR

NATtrol Zika Virus Range Verification Panel (4 x 0.5 mL)

NATZIKV-RV Zeptometrix 4 x 0.5 mL 529.44 EUR

NATtrol Zika Virus (PRVABC59) Range Verification Panel (4 x 0.5 mL)

NATZIKV(PRV)-RV Zeptometrix 4 x 0.5 mL 529.44 EUR

NATtrol MRSA Panel (4 X 0.5 mL)

NATMRSAP-C Zeptometrix 4 X 0.5 mL 284 EUR

NATtrol Vaginal Panel (24 x 0.5 mL)

NATVP-BD Zeptometrix 24 x 0.5 mL 1003.68 EUR

NATtrol T.vaginalis Verification Panel (17 x 0.7 mL)

NATTVGP-C Zeptometrix 17 x 0.7 mL 645.92 EUR

NATtrol MRSA/SA Panel (5 X 0.5 mL)

NATMRSA/SAP-C Zeptometrix 5 X 0.5 mL 340.16 EUR

NATtrol Clostridium difficile Verification Panel (6 X 1 mL)

NATCDIVP-C Zeptometrix 6 X 1 mL 532.56 EUR

NATtrol CARBA-R Verification Panel (10 x 0.06 mL)

NATCRVP-C Zeptometrix 10 x 0.06 mL 270.48 EUR

NATtrol Respiratory Verification Panel (RVP) (20 X 0.6 mL)

NATRVP-IDI Zeptometrix 20 X 0.6 mL 850.8 EUR

SeroDetect Dengue Fever Verification Panel (10 X 0.5 mL)

KZMC028 Zeptometrix 10 X 0.5 mL 272.56 EUR

SeroDetect West Nile Virus Verification Panel (10 X 0.5 mL)

KZMC027 Zeptometrix 10 X 0.5 mL 278.8 EUR

NATtrol Influenza Verification Panel (18 x 0.5mL)

NATFVP(XP)-C Zeptometrix 18 x 0.5mL 645.92 EUR

NATtrol MRSA Verification Panel (6 X 0.5mL)

NATMRSANP-C Zeptometrix 6 X 0.5mL 398.4 EUR

NATtrol Respiratory Verification Panel (20 x 0.2mL)

NATRVP-GMK Zeptometrix 20 x 0.2mL 1018.24 EUR

NATtrol Respiratory Verification Panel (20 x 0.25mL)

NATRVP-QIA Zeptometrix 20 x 0.25mL 772.8 EUR

NATtrol Influenza/RSV Verification Panel (21 x 0.5mL)

NATFRVP-C Zeptometrix 21 x 0.5mL 765.52 EUR

NATtrol Strep A Verification Panel (24 x 0.1mL)

NATSAVP1-C Zeptometrix 24 x 0.1mL 632.4 EUR

NATtrol MTB Verification Panel (5 x 0.6mL, 6 x 1.6mL)

NATMTBP-C Zeptometrix 5 x 0.6mL, 6 x 1.6mL 555.44 EUR

NATtrol Respiratory Verification Panel (15 x 0.5mL; 2 x 1mL)

NATRVP-NNS Zeptometrix 15 x 0.5mL; 2 x 1mL 696.88 EUR

NATtrol Respiratory Verification Panel 2 (23 x 0.6mL) (Ea)

NATRVP2-BIO Zeptometrix 23 x 0.6mL 971.44 EUR

SeroDetect HBsAg Verification Panel (5 X 1.5 mL)

KZMC007 Zeptometrix 5 X 1.5 mL 278.8 EUR

NATtrol EV Panel (20 X 0.2 mL)

NATEVP-C Zeptometrix 20 X 0.2 mL 601.2 EUR

HCV Genotype Panel (14 X 0.5 mL)

KZMC049 Zeptometrix 14 X 0.5 mL 2191.36 EUR

NATtrol RSV Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ047 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 232 EUR

NATtrol Norovirus Negative Control (6 X 0.5 mL)

MDZ052 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 213.28 EUR

NATtrol GBS Positive Control (6 x 0.5 mL)

MDZ053 Zeptometrix 6 x 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol GBS Negative Control (6 X 0.5 mL)

MDZ054 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol MRSA Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ059 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol SA Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ061 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol Influenza Negative Control (6 X 0.5 mL)

NATCXVA9-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 232 EUR

NATtrol GBS Negative Control (6 X 0.5 mL)

NATLAC-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol MRSA Positive Control (6 X 0.5 mL)

NATMRSA-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 307.92 EUR

NATtrol SA Positive Control (6 X 0.5 mL)

NATMSSA-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 307.92 EUR

NATtrol GBS Positive Control (6 X 0.5 mL)

NATSAG-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 315.2 EUR

SeroDetect HIV-Ab Verification Panel (5 X 1.5 mL)

KZMC006 Zeptometrix 5 X 1.5 mL 278.8 EUR

SeroDetect Anti-HBs Verification Panel (6 X 1.5 mL)

KZMC008 Zeptometrix 6 X 1.5 mL 278.8 EUR

SeroDetect Anti-HBcore Verification Panel (5 X 1.5 mL)

KZMC009 Zeptometrix 5 X 1.5 mL 278.8 EUR

SeroDetect Anti-HCV Verification Panel (5 X 1.5 mL)

KZMC010 Zeptometrix 5 X 1.5 mL 278.8 EUR

SeroDetect HTLV Ab Verification Panel (5 X 1.5 mL)

KZMC011 Zeptometrix 5 X 1.5 mL 278.8 EUR

NATtrol BC/GP Panel (10 X 0.75 mL)

NATBC/GP-NNS Zeptometrix 10 X 0.75 mL 626.16 EUR

NATtrol BC/GN Panel (12 X 0.75 mL)

NATBCGN-NNS Zeptometrix 12 X 0.75 mL 726 EUR

NATtrol CT/NG Panel (17 X 1.2 mL)

NATCT/NGP-C Zeptometrix 17 X 1.2 mL 873.68 EUR

NATtrol Meningitis/Encephalitis Panel (14 x 0.4 mL)

NATMEP-BIO Zeptometrix 14 x 0.4 mL 636.56 EUR

NATtrol GI Panel (17 x 0.25mL; 2 x 0.85 mL)

NATGIP-ABC Zeptometrix 17 x 0.25mL; 2 x 0.85 mL 761.36 EUR

NATtrol GI Panel (22 x 0.25mL; 4 x 0.85 mL)

NATGIP-BIO Zeptometrix 22 x 0.25mL; 4 x 0.85 mL 943.36 EUR

NATtrol Epstein Barr Virus (EBV) Strain: B95-8 (Linearity Panel (6 X 0.5 mL)

NATEBV-LIN Zeptometrix 6 X 0.5 mL 577.28 EUR

NATtrol Clostridium difficile Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ040 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 323.52 EUR

NATtrol Clostridium difficile Negative Control (6 X 0.5 mL)

MDZ041 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 323.52 EUR

NATtrol Influenza/RSV Negative Control (6 X 0.5 mL)

MDZ045 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 226.8 EUR

NATtrol Norovirus GI Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ050 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 213.28 EUR

NATtrol Norovirus GII Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ051 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 213.28 EUR

NATtrol MRSA/SA Negative Control (6 X 0.5 mL)

MDZ060 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol Clostridium difficile Positive Control (6 x 0.5 mL)

NATCDI-6MC Zeptometrix 6 x 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol Clostridium difficile Negative Control (6 x 0.5 mL)

NATCSO-6MC Zeptometrix 6 x 0.5 mL 315.2 EUR

NATtrol Influenza/RSV Positive Control (6 x 0.5 mL)

NATFLURSV-6C Zeptometrix 6 x 0.5 mL 226.8 EUR

NATtrol MRSA/SA Negative Control (6 X 0.5 mL)

NATMSSE-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 307.92 EUR

SeroDetect HIV-Ab Range Verification Panel (10 X 1.5 mL)

KZMC024 Zeptometrix 10 X 1.5 mL 278.8 EUR

Respiratory Verification Panel (6 X 1.5mL)

KZMC037 Zeptometrix 6 X 1.5mL 97.84 EUR

NATtrol BK Virus Linearity Panel (6 X 0.25 mL)

NATBK-LIN Zeptometrix 6 X 0.25 mL 529.44 EUR

NATtrol Respiratory Pathogen Panel -1 (6 x 0.25 mL)

NATRPP-1 Zeptometrix 6 x 0.25 mL 464.96 EUR

NATtrol Pneumonia Panel-Quantifiable Bacteria (17 x 0.2 mL, 3 x 1.2 mL)

NATPPQ-BIO Zeptometrix 17 x 0.2 mL, 3 x 1.2 mL 719.76 EUR

Hepatitis E Positive Titer Panel (24 X 0.5 mL)

KZMC003 Zeptometrix 24 X 0.5 mL 1967.76 EUR

Influenza Rapid Test Verificaiton Panel (20 X 0.5 mL)

KZMC021 Zeptometrix 20 X 0.5 mL 278.8 EUR

NATtrol Rotavirus (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATROTA-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Influenza A/B Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ046 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 226.8 EUR

NATtrol Norovirus GI/GII Positive Control (6 X 0.5 mL)

MDZ049 Zeptometrix 6 X 0.5 mL 213.28 EUR

NATtrol Influenza A/B Positive Control (6 X 0.5 mL)

NATFLUA/B-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 232 EUR

NATtrol Influenza A H1N1 Positive Control (6 X 0.5 mL)

NATFLUAH1N1-6MC Zeptometrix 6 X 0.5 mL 232 EUR

HIV 1/2 Rapid Test Verification Panel (10 X 0.25 mL)

KZMC029 Zeptometrix 10 X 0.25 mL 196.64 EUR

NATtrol Respiratory Validation Panel (RVP) (Qualitative) (13 X 0.2 mL)

NATRVP-1 Zeptometrix 13 X 0.2 mL 688.56 EUR

NATtrol Respiratory Validation Panel (RVP) (Qualitative) (17 X 0.2 mL)

NATRVP-3 Zeptometrix 17 X 0.2 mL 863.28 EUR

NATtrol BCID Panel (23 x 0.2mL)

NATBCP-BIO Zeptometrix 23 x 0.2mL 948.56 EUR

HIV Seroconversion Panel Donor# 65404 (7 X mL)

HIV9013 Zeptometrix 7 X mL 1548.64 EUR

NATtrol Clostridium difficile (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATCDI-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Campylobacter jejuni (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATCJE-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Escherichia coli (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATECO(933)-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Escherichia coli (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATECO(ETEC)-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Entamoeba histolytica (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATEHI(DS4)-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Shigella sonnei (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATSSO-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Salmonella typhimurium (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATSTY-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

SeroDetect HCV-Ab Mixed Titer Verification Panel I (15 X 0.25 mL)

KZMC022 Zeptometrix 15 X 0.25 mL 266.32 EUR

NATtrol Pneumonia Panel-Atypical Bacteria & Viruses (12 x 0.2mL, 2 x 1.2 mL)

NATPPA-BIO Zeptometrix 12 x 0.2mL, 2 x 1.2 mL 521.12 EUR

HBV Seroconversion Panel Donor# 61799 (7 X 1 mL)

HBV6274 Zeptometrix 7 X 1 mL 859.12 EUR

HBV Seroconversion Panel Donor# 61066 (7 X 1 mL)

HBV6275 Zeptometrix 7 X 1 mL 859.12 EUR

HBV Seroconversion Panel Donor# 63701 (7 X 1 mL)

HBV6279 Zeptometrix 7 X 1 mL 859.12 EUR

HBV Seroconversion Panel Donor# 64132 (7 X 1 mL)

HBV6293 Zeptometrix 7 X 1 mL 859.12 EUR

HCV Seroconversion Panel Donor# 69654 (7 X 1 mL)

HCV10002 Zeptometrix 7 X 1 mL 986 EUR

HCV Seroconversion Panel Donor# 65470 (7 X 1 mL)

HCV10010 Zeptometrix 7 X 1 mL 986 EUR

HCV Seroconversion Panel Donor# 67116 (7 X 1 mL)

HCV10028 Zeptometrix 7 X 1 mL 986 EUR

HCV Seroconversion Panel Donor# 420245049 (7 X 1 mL)

HCV10057 Zeptometrix 7 X 1 mL 1548.64 EUR

HCV Seroconversion Panel Donor# 420299823 (7 X 1 mL)

HCV10058 Zeptometrix 7 X 1 mL 1548.64 EUR

HCV Seroconversion Panel Donor# 90163052 (7 X 1 mL)

HCV10071 Zeptometrix 7 X 1 mL 1548.64 EUR

HCV Seroconversion Panel Donor# 63318 (7 X 1 mL)

HCV6227 Zeptometrix 7 X 1 mL 1548.64 EUR

HIV Seroconversion Panel Donor# 63331 (7 X 1 mL)

HIV6248 Zeptometrix 7 X 1 mL 1548.64 EUR

HIV Seroconversion Panel Donor# 68205 (7 X 1 mL)

HIV9026 Zeptometrix 7 X 1 mL 1548.64 EUR

HIV Seroconversion Panel Donor# 67860 (7 X 1 mL)

HIV9028 Zeptometrix 7 X 1 mL 1548.64 EUR

NATtrol Adenovirus Type 40 (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATADV40-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

NATtrol Adenovirus Type 41 (Stool Matrix) (0.5 mL)

NATADV41-GP Zeptometrix 0.5 mL 93.68 EUR

statistische Analyse

Probit-Analysen für die Nachweisgrenze mit einer Nachweiswahrscheinlichkeit von 95 % wurden unter Verwendung von SPSS Version 8.0 (IBM, Armonk, NY) durchgeführt. Der Chi-Quadrat-Test wurde mit Microsoft Excel 2013 (Redmond, WA) durchgeführt. P -Werte von 0,05 wurden als statistisch signifikant angesehen. Konfidenzintervalle (CI) wurden unter Verwendung von Graph-Pad (La Jolla, CA) bestimmt.

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